Родился 20 августа 1789 года в селе Суук-Су, тогда Феодосийского уезда Таврической губернии, в семье уроженца Швейцарии, директора казённых виноградных садов в Судацкой долине Якова Фабра и Марии Гроскрейц (Гроскройц), немки по происхождению.
Служебную карьеру он начал 25 мая 1804 года канцеляристом в Таврической казённой экспедиции. В 1808-1819гг. - главный форштмайстер-смотритель лесов всей Таврической губернии. В 1819 году поступил на службу в канцелярию Таврического гражданского губернатора «для ведения следственных дел». В 1823-1825гг. - советник губернского правления, 17 декабря 1825г. – 11 февраля 1833г. - Таврический губернский прокурор. В 1833-1847гг. - начальник канцелярии графа Воронцова. В 1833г. получил чин статского советника, в 1837г. — действительного статского советника. С 1841 года состоял членом Совета Министра внутренних дел. 24 января 1847 г. Андрей Яковлевич Фабр был назначен екатеринославским губернатором. В 1857г. вышел в отставку в чине тайного советника и переехал в Симферополь, где продолжил свои занятия общественной и научной деятельностью. По выходе в отставку Фабра наградили орденом Белого Орла. В Крыму он не сидел сложа руки. Пытался заниматься общественно полезной деятельностью. Был членом от правительства Таврического губернского присутствия по крестьянскому делу.
Скончался 24 января 1863 года в Симферополе. Похоронен в собственном имении Ана-Эли близ Симферополя в специальном склепе, возле могилы его любимой матери, прах которой он когда-то перенёс из Одессы.
![]() |